Manuel Pérez Cortés é Engenheiro Aeronáutico desde 1982 e Doutor Engenheiro Aeronáutico desde 1985 pela Universidade Politécnica de Madrid. Completou a sua formação com um PDD do IESE. É Professor Titular de Universidade na Escola Técnica Superior de Engenheiros Aeronáuticos da Universidade Politécnica de Madrid desde 1987. Além disso, é Diretor da Escola Espanhola de Ensaios em Voo e Aeronavegabilidade da UPM (E4A).
A sua vida profissional esteve ligada simultaneamente à Universidade, onde é docente desde o final do curso, e à empresa GMV, onde trabalha desde a sua criação no ano 1984.
Na GMV trabalhou em diferentes campos, sobretudo no desenvolvimento de aplicações para o setor aeroespacial e de defesa e segurança, tanto em sistemas de navegação por satélite como em simuladores de treino, de investigação e de engenharia de diferentes tipos de veículos; em sistemas de comando e controlo e, em geral, na integração de sistemas de informação. Na GMV ocupou diferentes postos e, na atualidade, é Diretor-geral de Defesa e Segurança.